高效毛細(xì)管電泳儀(HPCE)是以毛細(xì)管為分離通道，以高壓直流電場為驅(qū)動(dòng)力，利用荷電粒子之間的淌度差異和分配系數(shù)差異進(jìn)行分離，是分析科學(xué)繼高效液相色譜儀之后的又一重大進(jìn)展，使分析科學(xué)從微升級(jí)進(jìn)入到了納升級(jí)水平，不僅使單細(xì)胞乃至單分子分析成為可能，也使蛋白質(zhì)和核酸等生物大分子分析有了新的轉(zhuǎn)機(jī)。HPCE與高效液相色譜儀比較如下：

　　一、相同點(diǎn)：

　　1、檢測器：

　　HPCE和高效液相色譜儀均可采用紫外檢測器、熒光檢測器和電化學(xué)檢測器等。但由于HPCE采用在柱檢測，光路短，靈敏度和線性范圍都不如高效液相色譜儀。

　　2、定性和定量方法：

　　HPCE的定性和定量方法與高效液相色譜儀相同，采用出峰時(shí)間定性，峰面積或峰高定量。

　　3、柱效和分辨率：

　　HPCE的柱效和分辨率計(jì)算方法與高效液相色譜儀相同。

　　二、不同點(diǎn)：

　　1、分離原理：

　　(1)HPCE：基于組分在載體電解質(zhì)中遷移速度的不同。

　　(2)高效液相色譜儀：基于組分在固定相和流動(dòng)相之間分配系數(shù)的不同。

　　2、分離模式：

　　(1)HPCE：毛細(xì)管區(qū)帶電泳、毛細(xì)管膠束電動(dòng)色譜、毛細(xì)管凝膠電泳、毛細(xì)管等電聚焦電泳和毛細(xì)管等速電泳等。

　　(2)高效液相色譜儀：正相色譜、反相色譜、離子交換色譜和凝膠色譜等。

　　3、分離柱：

　　(1)HPCE：小內(nèi)徑毛細(xì)管柱內(nèi)裝不同載體電解質(zhì)。

　　(2)高效液相色譜儀：小內(nèi)徑毛細(xì)管柱內(nèi)裝不同固定相。

　　4、進(jìn)樣方式：

　　(1)HPCE：電動(dòng)進(jìn)樣、壓力進(jìn)樣和擴(kuò)散進(jìn)樣。

　　(2)高效液相色譜儀：微量注射器進(jìn)樣、六通閥進(jìn)樣和自動(dòng)進(jìn)樣器進(jìn)樣。

　　5、進(jìn)樣體積：

　　(1)HPCE：納升級(jí)。

　　(2)高效液相色譜儀：微升級(jí)。

　　6、溶質(zhì)驅(qū)動(dòng)方式：

　　(1)HPCE：以高壓直流電場為驅(qū)動(dòng)力。

　　(2)高效液相色譜儀：以高壓輸液泵驅(qū)動(dòng)流動(dòng)相。

　　7、采用毛細(xì)管的目的：

　　(1)HPCE：有效散熱，使徑向溫度梯度更小。

　　(2)高效液相色譜儀：消除渦流擴(kuò)散，縮短組分在流動(dòng)相中的傳質(zhì)過程。

　　8、柱效：

　　(1)HPCE：72萬TP/m，大分子更大，尤其生物大分子可達(dá)3000萬TP/m，能檢測到單細(xì)胞和單分子水平。

　　(2)高效液相色譜儀：一般為25TP/m，大分子更小。

　　9、柱價(jià)：

　　(1)HPCE：柱價(jià)低，

　　(2)高效液相色譜儀：柱價(jià)高，且易沾污，易失效。

　　10、分離液：

　　(1)HPCE：在水溶液介質(zhì)中進(jìn)行，不污染環(huán)境。

　　(2)高效液相色譜儀：常在含有機(jī)溶劑(如甲醇等)介質(zhì)中進(jìn)行，易造成環(huán)境污染。